Очистка бактериальной лакказы на хроматографической колонке
20 и 21 апреля 2022 года в Пущино состоялась школа-конференция для молодых ученых «Фундаментальная и прикладная микробиология». В эти дни исследователи из Архангельска, Воронежа, Москвы, Новосибирска, Санкт-Петербурга, Белгорода, Тулы, Тюмени, Орла и Пущино знакомились с микробиологией во всех ее проявлениях. Участники искали бактериофагов против бацилл и энтерококков, осваивали подходы к работе с анаэробными бактериями и археями, очищали бактериальную лакказу, способную обесцвечивать красители, знакомились с основными технологиями секвенирования геномов и метагеномов, а также смотрели на клетки дрожжей и бактерий с помощью флуоресцентного микроскопа.
Татьяна Ловдина, магистрант Северного (Арктического) федерального университета имени М.В. Ломоносова и стажер-исследователь Федерального исследовательского центра комплексного изучения Арктики имени академика Н.П. Лаверова УрО РАН, приехала на Школу из Архангельска. «Когда узнала о школе, даже не возникло сомнений отпустят или не отпустят меня на работе и учёбе, ведь анаэробы и микроскопия основа моей исследовательской работы (считай, что жизни). Я наконец-то увидела ту самую медную колонку для анаэробов и даже посмотрела на метаногенов в микроскоп. Мы красили дрожжи и наблюдали клеточные процессы в них, нашли тайны и вопросы, ответы на которые предстоит найти. Спасибо организаторам за заботу и готовность сотрудничать! На школе мы получили не только новые знания, но и новые знакомства, идеи, поддержку и помощь в наших исследованиях!»
Сотрудник лаборатории анаэробных микроорганизмов ИБФМ РАН на практикуме «Практические навыки работы с анаэробными бактериями и археями». Фото: Чугреев Михаил
«Одно из направлений Школы было посвящено культивированию облигатных анаэробов. Оно актуально для меня, так как мой научный проект как раз связан с изучением и получением пробиотических штаммов, которые в большинстве случаев совсем не любят кислород» - рассказывает Анастасия Щербакова, магистрант Университета ИТМО, Санкт-Петербург - «Когда я узнала, что практикум ведет доктор биологических наук Щербакова Виктория Артуровна, я сразу же подала заявку, потому что давно хотела познакомиться с ней и получить ценные советы в области моей научной работы. Лекции и практикумы были полезны и тем, кто никогда не работал с анаэробами, и людям с опытом. Нам рассказали основы культивирования анаэробов и практические тонкости при работе с ними. Также провели экскурсию по лаборатории и показали оборудование, а после этого Виктория Артуровна обсудила наши личные проекты и каждому дала совет, в каком направлении можно двигаться, как решить ту или иную проблему в проекте и т.д. Думаю, что каждый из группы получил ответ на свой вопрос»
В рамках Школы проходила постерная сессия, что позволило молодым ученым рассказать о своей работе и обсудить ее с другими участниками. С презентацией своего проекта выступила и Анастасия Щербакова из ИТМО.
«В рамках школы была возможность поучаствовать в постерной сессии с представлением своего проекта. Я не могла упустить такую возможность и очень рада этому, потому что аудитория конференции проявила большой интерес к моей работе, и даже появились договоренности о коллаборациях»
Анастасия Щербакова, магистрант ИТМО. Фото предоставлено участницей Школы
Участие в Школе позволяет начинающим исследователям познакомиться с новыми для себя методами и подходами, а их старшим коллегам узнать о том, над чем начинают работать в других регионах
Трубицина Любовь, кандидат биологических наук и сотрудник Института биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН – обособленного подразделения ФИЦ ПНЦБИ РАН, отвечала за направление «Хроматографические методы очистки белков». «Ребята быстро увлеклись процессом очистки белков, сами готовили буферные растворы, познакомились с работой перистальтического насоса, провели успешную очистку рекомбинантной бактериальной лакказы. Участники внимательно слушали теоретическую часть, посвящённую особенностям получения рекомбинантных белков и особенностям подбора условий для их успешной очистки, задавали много вопросов и рассказывали о том, как их работа связана с очисткой ферментов. Надеюсь, ребятам было интересно, и они почерпнули новые знания, которые пригодятся им для дальнейшей научной деятельности»
Очищенная бактериальная лакказа. Фото: Чугреев Михаил
Мероприятие прошло при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2027 годы, в рамках реализации проекта по теме «Разработка подходов для профилактики и преодоления резистентности бактерий к противомикробным препаратам» (Уникальный идентификатор контракта RF----193021X0001) по Соглашению № 075-10-2021-113 от 12.10.2021г о предоставлении из федерального бюджета грантов в форме субсидий.
Материал подготовила Ирина Позднякова-Филатова, младший научный сотрудник ИБФМ РАН
