ВКМ – крупнейшая в России коллекция микроорганизмов по показателю разнообразия поддерживаемых культур и одна из крупнейших по общей численности фонда (около 20000 штаммов). Включает представителей всех основных надцарств (грибы, бактерии, археи) и физиологических групп (в т.ч., анаэробы и экстремофилы), более 2500 типовых (эталонных) штаммов видов, а также объекты интеллектуальной собственности, депонированные в ВКМ в связи с патентной процедурой, и другие организмы с уникальными свойствами и биотехнологическим потенциалом. Открытый каталожный фонд (www.vkm.ru/Catalogue.htm) содержит более 7500 штаммов (более 750 родов и 3300 видов), охарактеризованных и идентифицированных в соответствии с современной системой классификации.
Каталожная база данных ВКМ интегрирована в международную поисковую систему Straininfo. Сведения по культурам открытого фонда ВКМ включены в Глобальный электронный каталог микроорганизмов WDCM/GCM Всемирной федерации коллекций культур (WFCC). Уникальная информационно-справочная система FungalDC связана с основными информационными ресурсами мира по грибам (WDCM, GenBank, IndexFungorum, MycoBank, StrainInfo), обеспечивает доступ к имеющейся в мире информации по различным видам грибов (таксономия, номенклатура, биотехнология, вопросы биобезопасности и др.).
Наряду с предоставлением и депонированием штаммов микроорганизмов для различных целей, ВКМ предоставляет широкий спектр научно-сервисных услуг, в их числе, услуги по идентификации микроорганизмов, определению их таксономических характеристик, требуемых для описании новых таксонов, а также проводит ряд других видов работ по заявкам пользователей (см. раздел Услуги).
На базе ВКМ и с использованием фонда и информационных ресурсов ВКМ возможно выполнение работ во многих областях фундаментальной и прикладной науки – всюду, где объектами изучения или практических разработок являются штаммы микроорганизмов, их свойства, осуществляемые с их участием процессы или синтезируемые биомолекулы и биополимеры.
Участие в Федеральной научно-технической программе развития генетических технологий на 2019-2027 годы
Проект «Создание и реализация на базе Всероссийской коллекции микроорганизмов сетевого взаимодействия консорциума российских микробных коллекций (ВКМ, UNIQEM, ИЭГМ) с целью развития фондов, информационных ресурсов и сервисных услуг для повышения эффективности исследований в области генетических технологий»
(Соглашение от 28 сентября 2021г. № 075-15-2021-1051)
Соисполнители проекта:
ФГБУН Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук» (ФИЦ Биотехнологии РАН),
ФГБУН Федеральный исследовательский центр Пермский федеральный исследовательский центр УрО РАН
РЕЗУЛЬТАТЫ I-го ЭТАПА
Выполнены в полном объеме все запланированные исследования и мероприятия I-го этапа проекта, направленные на повышение эффективности исследований и разработок в области генетических технологий, сопряженных с изучением и практическим использованием микробного разнообразия.
В рамках общей задачи проекта по созданию российской распределенной информационной сети трех коллекций микроорганизмов, интегрированной с базами данных Наук о жизни, организован он-лайн выход на портал каждого участника проекта с сайта ВКМ (www.vkm.ru).; подготовлен список штаммов трех коллекций и данных по ним для включения в консолидированную каталожную базу данных. Расширены (ВКМ, ИЭГМ) и создана (UNIQEM) каталожные базы данных, а также специализированные базы данных ВКМ (по питательным средам, методам хранения, патентным штаммам, пользователям ВКМ, библиографии и т. д.).
Важным результатом работ первого этапа проекта стало увеличение объемов, качества и ценности фондов. Фонд ВКМ увеличен более чем на 300 новых культур, представителей редких или отсутствующих в ней и других коллекциях страны видов (родов) микроорганизмов. Идентифицировано в соответствии с современной системой более 500 штаммов различных групп микроорганизмов (бактерий, архей, мицелиальных и дрожжевых грибов).
На основе мирового и многолетнего собственного опыта усовершенствованы методы долгосрочного сохранения жизнеспособности и свойств коллекционных культур в ВКМ и ИЭГМ. Выполнены работы по развитию материально-технической базы: закуплено новое оборудование для культивирования, консервации и хранения новых массивов депонируемых микроорганизмов, а также вычислительная техника; отремонтированы и переоборудованы помещения отдела ВКМ.
Мероприятия по развитию инфраструктуры включали организацию Лаборатории биологии и геносистематики дрожжевых грибов в составе отдела ВКМ, что обусловлено, в том числе, масштабами задач по развитию фонда дрожжей ВКМ – одного из крупнейших в мире по показателям численности и таксономического разнообразия.
Деятельность по подготовке высоко квалифицированных микробиологов-систематиков состояла в привлечении молодых учёных к исследованиям по таксономической ревизии фондов коллекций с использованием методов генетических технологий и биоинформатики, и в организации школы-конференции для молодых ученых «Генетические технологии в микробиологии и микробное разнообразие» в рамках VII Пущинской конференции «Биохимия, физиология и биосферная роль микроорганизмов» (6-9 декабря 2021г.).
Выполненные исследования и мероприятия отвечают мировым тенденциям и направлениям исследований и работ в данной области. Выполнены на высоком методическом уровне, с учетом мирового и многолетнего собственного опыта, с использованием современных методов и оборудования.